肺結核需根據患者的臨床表現、影像學檢查以及實驗室檢查的結果綜合進行判斷，一般若痰液涂片檢查當中看到結核分枝桿菌且x光出現滲出、空洞、增殖等表現時，多可確診為肺結核。

肺結核診斷最可靠的依據是痰培養(yǎng)中檢測結核菌，另一些在組織病理檢查中結核感染，這兩個基本上是結核診斷相對可靠的依據。最常見的臨床檢查是用痰涂片尋找制酸菌，制酸菌呈陽性的患者大部分是結核分枝桿菌感染，但非核細菌或諾卡菌感染的一小部分是根據疾病的判斷，接受痰培養(yǎng)檢查。