甲氨蝶呤的副作用有以下幾個方面：第一、使患者出現惡心、嘔吐、腹瀉、胃痛、反酸、食欲減退、消化道出血等胃腸道反應。第二、導致肝腎功能異常，使患者出現黃疸、血尿、蛋白尿等情況，甚至引起肝纖維化、尿毒癥、脂肪肝等疾病。第三、引起咳嗽、氣短、脫發(fā)、皮膚瘙癢、皮膚長皮疹等副作用。第四、引起骨髓抑制，使患者血液中白細胞和血小板減少。患者在使用此藥物時若是出現過敏的情況，需及時停止用藥，防止引起嚴重后果。