小腦位于顱后窩，小腦幕下方，腦橋及延髓的背側(cè)。上方借小腦幕與枕葉隔開(kāi)，下方為小腦延髓池，腹側(cè)為腦橋和延髓，其間為第四腦室。

小腦以小腦下腳、中腳、上腳分別與延髓、腦橋及中腦相連。腦干上與間腦下與脊髓相連，包括中腦、腦橋和延髓。內(nèi)部結(jié)構(gòu)主要有神經(jīng)核、上下行傳導(dǎo)束和網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)。

腦干包含了除了嗅神經(jīng)、視神經(jīng)以外的所有神經(jīng)核。