做普通的腸鏡手術是會有疼痛，不適感的，并且可能疼痛感比較強烈，但是可以通過無痛腸鏡來檢查，無痛腸鏡可以在一定程度上減輕患者的疼痛。

腸鏡檢查是會讓患者有比較強烈的疼痛，不適感的，因為腸鏡的檢查工具有一米多長，在檢查的時候要把腸鏡全部放入腸道中，在進入腸道的途中，會經(jīng)過不容易進入的部位，在這些部位就會讓患者產(chǎn)生疼痛，不適感。

但是有些患者的痛覺神經(jīng)并不敏感，所以有些患者在做腸鏡的時候疼痛感就會比較小，因此是否會有疼痛還要根據(jù)患者的情況決定。

因為腸鏡的檢查是比較痛苦的，所以可以通過無痛腸鏡來做檢查。無痛腸鏡是在檢查前對進行麻醉，通過麻醉藥品的作用讓患者可以感覺不到在檢查過程中的疼痛，從而讓患者的檢查更加地輕松。

同時，在腸鏡檢查之后，腸道會受到一定的損傷，所以需要注意休息，不要過于操勞，勞累不利于檢查之后腸道功能的恢復。