HPV感染后從感染到出現(xiàn)可見病變時間個體差異大，低危型如尖銳濕疣潛伏期波動（因病毒載量等），高危型發(fā)展為癌前病變等需時長，受機體免疫、遺傳、年齡等因素影響，免疫力正常者可能清病毒，低下或有危險因素者易持續(xù)感染進展，年輕女性清除力強，年長免疫下降時風(fēng)險高。

低危型HPV感染：以引起尖銳濕疣為例，潛伏期平均約3個月，但可短至3周、長至8個月。這是因為低危型HPV主要引發(fā)皮膚黏膜的良性增生病變，當(dāng)病毒在局部持續(xù)增殖到一定程度時就會形成可見的疣體，個體間因病毒載量、局部免疫反應(yīng)等不同，時間有波動。

高危型HPV感染：高危型HPV持續(xù)感染是引發(fā)宮頸癌等惡性腫瘤的關(guān)鍵因素，其發(fā)展為癌前病變乃至癌癥通常需要較長時間，一般可能歷經(jīng)5-10年甚至更久。這是因為高危型HPV會整合到宿主細胞基因組中，逐步引起細胞的異常增殖和惡性轉(zhuǎn)化，而這個過程受機體免疫狀態(tài)、遺傳易感性等多方面影響，免疫力正常者可能清除病毒，免疫力低下或有其他危險因素（如吸煙、多性伴等）者則更易出現(xiàn)持續(xù)感染并緩慢進展。不同年齡人群感染后進程有別，年輕女性免疫系統(tǒng)相對活躍，清除病毒能力較強，而年長女性尤其是免疫力下降時，持續(xù)感染風(fēng)險升高，病變進展可能相對更快。