食管克羅恩病的診斷方法包括內(nèi)鏡檢查（食管鏡檢查可直接觀察病變，兒童操作需輕柔）、影像學(xué)檢查（X線鋇餐檢查可見黏膜皺襞等改變，兒童需控輻射劑量，CT及MRI助評估病變范圍等）、病理組織學(xué)檢查（內(nèi)鏡下活檢是確診關(guān)鍵，兒童活檢要取夠組織）、實(shí)驗(yàn)室檢查（血常規(guī)可現(xiàn)貧血等，炎癥標(biāo)志物在活動期常升高作病情活動度監(jiān)測指標(biāo)）。

影像學(xué)檢查

X線鋇餐檢查：可發(fā)現(xiàn)食管黏膜皺襞增粗、紊亂，有潰瘍時可見龕影，病變嚴(yán)重時可出現(xiàn)食管狹窄，呈節(jié)段性分布。不同年齡患者的X線表現(xiàn)可能有一定差異，兒童患者在檢查時要注意輻射劑量的控制。

CT及MRI檢查：有助于評估食管病變的范圍及周圍組織受累情況，對于判斷病情的嚴(yán)重程度有一定幫助。CT檢查可清晰顯示食管壁的增厚情況等，MRI檢查在某些方面可能具有更好的軟組織分辨力，能更準(zhǔn)確地評估病變細(xì)節(jié)，但檢查費(fèi)用相對較高。

病理組織學(xué)檢查

內(nèi)鏡下活檢：從食管病變處取組織進(jìn)行病理檢查是確診食管克羅恩病的關(guān)鍵。病理表現(xiàn)主要有黏膜下層淋巴細(xì)胞浸潤、非干酪樣肉芽腫形成等，但非干酪樣肉芽腫并非克羅恩病所特有，需結(jié)合臨床及其他檢查綜合判斷。對于兒童患者，活檢時要注意取到足夠的病變組織以保證病理診斷的準(zhǔn)確性，同時減少對食管黏膜的過度損傷。

實(shí)驗(yàn)室檢查

血常規(guī)：部分患者可出現(xiàn)貧血，白細(xì)胞計(jì)數(shù)可能在活動期升高。不同年齡患者的血常規(guī)指標(biāo)正常范圍不同，兒童的血常規(guī)指標(biāo)需參考兒童正常范圍來判斷是否異常。

炎癥標(biāo)志物：如C-反應(yīng)蛋白（CRP）、血沉（ESR）等在疾病活動期常升高，可作為病情活動度的監(jiān)測指標(biāo)。但這些指標(biāo)非特異性，需結(jié)合臨床其他表現(xiàn)綜合分析。