尿道旁腺囊腫主要因尿道旁腺腺管開口被阻塞致分泌物潴留引起，可能的阻塞因素有局部炎癥（如陰道炎等炎癥蔓延使腺管周圍充血水腫致開口堵塞）、損傷（外傷、器械檢查等致腺管損傷形成瘢痕阻礙排出）、先天性腺管異常（先天性狹窄、走行異常致分泌物排出不暢潴留成囊腫）。

局部炎癥：女性外生殖器部位的炎癥，如陰道炎等，炎癥可能蔓延至尿道旁腺，引起腺管周圍組織充血、水腫，進(jìn)而導(dǎo)致腺管開口堵塞。例如，細(xì)菌性陰道炎、霉菌性陰道炎等炎癥狀態(tài)下，炎性分泌物可能波及尿道旁腺，使腺管的正常引流受阻。不同年齡的女性都可能受到陰道炎的影響，年輕女性性生活活躍等因素可能增加陰道炎的發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)，而中老年女性由于雌激素水平下降等原因，也容易出現(xiàn)陰道局部抵抗力下降，引發(fā)炎癥。

損傷：外傷、器械檢查等可能造成尿道旁腺腺管的損傷。比如，在進(jìn)行導(dǎo)尿操作等醫(yī)療器械檢查時(shí)，如果操作不規(guī)范，可能損傷尿道旁腺的腺管，導(dǎo)致腺管開口處形成瘢痕等，從而阻礙分泌物的排出。對(duì)于接受過(guò)尿道相關(guān)操作的患者，術(shù)后需要密切關(guān)注尿道旁腺的情況，因?yàn)椴僮鲹p傷是可能的致病因素之一。

先天性腺管異常：部分女性可能存在尿道旁腺腺管先天性的狹窄、走行異常等情況，這使得分泌物排出不暢，長(zhǎng)期潴留后形成囊腫。先天性因素在出生時(shí)就已存在，對(duì)于有先天性腺管異常的個(gè)體，從生理結(jié)構(gòu)上就存在尿道旁腺分泌物引流的障礙，隨著年齡增長(zhǎng)等因素，更容易出現(xiàn)囊腫。