尿道下裂一般都需手術治療。手術的目的是：矯正陰莖畸形，伸直陰莖;重建尿道;切除多余包皮，陰莖頭整形使之外觀盡量完美。通過手術恢復其正常排尿和射精功能。
尿道下裂的整形手術已有100多年的歷史，手術方法也已有200余種。每種方法各有長短，歸納其手術方法主要為一期成形術及分期成形術兩大類：一期成形術是矯正陰莖下曲畸形和重建尿道于一次手術完成;分期手術是先矯正陰莖下曲畸形，并作好包皮皮膚的轉移，待6～12個月后，再施行尿道重建的手術。手術方法的選擇應根據尿道下裂的類型、病人的具體情況、手術者的經驗與習慣靈活掌握。一般來說，陰莖型尿道下裂可采用一期手術，陰囊型及會陰型尿道下裂則根據情況分別采用一期或分期手術。關于手術的年齡，各家意見尚不統(tǒng)一，多數學者認為學齡前應完成全部治療。