重癥肌無力一般為慢性病程，具有緩解和復(fù)發(fā)的傾向，不同病人的病程可能有很大的不同，眼肌型病人可在20～30年內(nèi)不出現(xiàn)其它肌肉受累的癥狀。延髓肌和呼吸肌受累的病人預(yù)后較差，但也可顯著緩解并持續(xù)數(shù)年之久。以急性暴發(fā)性起病者可在數(shù)周或數(shù)月內(nèi)死亡。
病程末期，病員常臥床不起，明顯消瘦。文獻報告重癥肌無力死亡率為5.7%，肌無力危象病死率為15，4～50%，起病第一年殘廢率最高，反復(fù)感染，呼吸肌麻痹，激素治療不當(dāng)，以及合并心肌損害突發(fā)心跳停止等均為死亡原因。
一般說來，以眼肌無力作為首發(fā)癥狀者，預(yù)后最好，合并甲亢、心肌病變時預(yù)后差。病程一年內(nèi)出現(xiàn)肌無力危象預(yù)后不佳。全身型易發(fā)生肌無力危象，與預(yù)后密切相關(guān)。