短腸綜合征的診斷方式主要包括體格檢查、實驗室檢查、影像學檢查等，具體如下：

短腸綜合征早期的診斷方式為體格檢查，主要包括視診、觸診、叩診和聽診等。實驗室檢查的主要指標包括血常規(guī)、維生素、微量元素濃度、肝腎功能、脂肪酸等，這類指標可以反映短腸綜合征影響的相關腸道功能，間接提高短腸綜合征的確診幾率。影像學檢查則包括X線、CT檢查、超聲檢查、磁共振檢查等，這類檢查可以明確病變部位，同時還可幫助排除其他腸道疾病。