引起亞急性甲狀腺炎的原因主要有感染因素，遺傳因素和自身免疫因素可能會增加患病幾率。

1.感染因素

若是一種或多種病毒同時感染會繼發(fā)亞急性甲狀腺炎，如麻疹、EB病毒、腺病毒、?？刹《?、流感病毒、流、腸病毒等。

2.遺傳因素

因地理分布和種族有差異，部分患者具有人類白細胞抗原，從而增加患有亞急性甲狀腺炎的幾率。

3.自身免疫因素

部分亞急性甲狀腺炎患者會存在自身免疫抗體，這些抗原釋放能使T淋巴細胞致敏，從而增加患病的風險。