懷孕三個月肚子微微痛可能由于過度勞累、作息不規(guī)律以及過度勞累等因素誘發(fā)的先兆流產(chǎn)所致。建議患者積極進行B超檢查，一旦確診為先兆流產(chǎn)引起，則需要遵醫(yī)囑口服黃體酮藥物或者肌內(nèi)注射黃體酮藥物進行治療。

根據(jù)你的提示，懷孕三個月，肚子有時會痛，建議去醫(yī)院做B超檢查觀察胎兒，胎盤，羊水等各項指標(biāo)，如果沒有問題。不用過度擔(dān)心，注意休息，定期產(chǎn)檢。